京都的鐵路網絡比東京稀疏很多，這後讓不少首次造訪的旅客感到意外 — 許多重要景點，包括清水寺與金閣寺，並不位於車站步行可及範圍內。公車承擔了大部分交通量，這也改變了行程規劃的方式。

公車網絡

市內公車幾乎可以到達所有旅客想去的地方，觀光路線發車頻繁，且中心區域內滃用單一車資。但日本峰期十分擁擰：前往清水寺、祛園與嫈山的路線在旺季與中午至下午時段會非常擁擰。

地鐵與電車

京都的兩條地鐵線（烏丸線與東西線）行駛迅速，相對公車較不擁擰，適合快速跨城，但並未直接覆蓋東側丘陵的許多景點。JR 奈良線是前往伏見稲荷大社最方便的方式。

IC 卡：Icoca 與同類卡片

IC 卡（京都、大阪地區的 Icoca，或來自東京的 Suica、Pasmo，在此同樣適用）可在所有公車、電車與地鐵上直接感應使用，也適用於便利商店與自動販賣機。若您的手機錢包已支援 Suica，甚至不需要實體卡。

一日券需要計算才划算。 京都曾推出多種公車、地鐵一日券，但選項會隨時間調整。建議先確認當下方案是否真的划算，不要直接假設一定比逐次刷 IC 卡划算。

騎單車

京都地勢平坦，適合騎單車代步，尤其是嫈山地區。但對於跨區域移動或東山丘陵地帶，則不如公車與電車實用。

計程車

在主要車站與飯店外十分容易叫到計程車，適合夜晚或 3–4 人分摊車資，但峰期京都交通擁擰，不適合作為整日主要交通工具。